A atuação política de Nelson Pelegrino é, e sempre foi, norteada pela defesa incansável dos direitos humanos. Enquanto Deputado Estadual, Pelegrino foi presidente da Comissão de Direitos Humanos da Assembléia Legislativa da Bahia, por sete anos, em sete reeleições consecutivas, entre os anos de 1992 e 1999. Ajudou a criar o Conselho Estadual dos Direitos Humanos e recebeu, em 1993, o prêmio Destaque Parlamentar, por sua luta em defesa dos oprimidos e injustiçados. Quando foi eleito Deputado federal, já no primeiro ano de mandato (1999) foi 1º vice-presidente da Comissão de Direitos Humanos e, em 2000, foi eleito presidente. Ao todo, somam-se 16 anos de atuação voltados para os direitos do cidadão, uma das bandeiras do Partido dos Trabalhadores.
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